DNA大小選擇后DNA采血卡中ctDNA的檢測

  循環(huán)腫瘤DNA(CtDNA)的研究和臨床應(yīng)用的新進(jìn)展受到樣本收集的實(shí)際考慮而受到限制。全基因組測序(WGS)越來越多地被用于ctDNA分析、識別拷貝數(shù)改變、片段大小模式和其他基因組特征，我們假設(shè)低深度的WGS數(shù)據(jù)可能是從極少量的無細(xì)胞dna中產(chǎn)生的，而片段大小的選擇可能有效地去除小容量血液中的基因組dna(Gdna)污染。使用DNA采血卡具有實(shí)際優(yōu)勢，因?yàn)檫@些方法易于收集，便于連續(xù)取樣，并支持前瞻性人類研究中的新研究設(shè)計、動物模型和通過小批量去除gDNA來擴(kuò)大檔案樣本的利用。

  因此，我們制定了從DNA采血卡中分離和分析無細(xì)胞DNA的方法。通過對一例黑色素瘤患者50μL冷凍全血干血斑的分析，根據(jù)腫瘤特異性體細(xì)胞拷貝數(shù)的改變對ctDNA進(jìn)行了鑒定，發(fā)現(xiàn)其片段大小與傳統(tǒng)方法處理的血漿中的片段大小相似。我們將此方法擴(kuò)展到從小鼠移植瘤模型中檢測干血斑中的無腫瘤細(xì)胞DNA，并能夠從原始移植腹水中識別ctDNA。我們的數(shù)據(jù)表明，ctDNA可以在干血斑中被檢測和監(jiān)測。這將為從病人收集樣本提供新的方法。